Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Edrf1Q6GQV7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Edrf1Q6GQV7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Edrf1Q6GQV7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Edrf1Q6GQV7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Edrf1Q6GQV7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Edrf1Q6GQV7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Edrf1Q6GQV7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Edrf1Q6GQV7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Edrf1Q6GQV7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Edrf1Q6GQV7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Edrf1Q6GQV7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Edrf1Q6GQV7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Edrf1Q6GQV7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edrf1Q6GQV7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edrf1Q6GQV7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms