Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc3c1Q6DFV6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3c1Q6DFV6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.1 ms