Protein–RNA interactions for Protein: Q64729

Tgfbr1, TGF-beta receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr1Q64729 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr1Q64729 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfbr1Q64729 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms