Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nhlh2Q64221 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlh2Q64221 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms