Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20854Q62461 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20854Q62461 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms