Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl12Q62401 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl12Q62401 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl12Q62401 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms