Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim28Q62318 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Trim28Q62318 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim28Q62318 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms