Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spock1Q62288 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spock1Q62288 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms