Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ss18Q62280 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ss18Q62280 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ss18Q62280 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Ss18Q62280 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ss18Q62280 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ss18Q62280 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Ss18Q62280 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Ss18Q62280 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ss18Q62280 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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