Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpcQ62241 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SnrpcQ62241 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms