Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sycp1Q62209 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sycp1Q62209 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms