Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema3cQ62181 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema3cQ62181 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms