Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctr9Q62018 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctr9Q62018 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms