Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg2Q61878 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prg2Q61878 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms