Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga6Q61739 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga6Q61739 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga6Q61739 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms