Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccne1Q61457 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccne1Q61457 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccne1Q61457 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms