Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcolceQ61398 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcolceQ61398 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcolceQ61398 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcolceQ61398 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcolceQ61398 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcolceQ61398 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcolceQ61398 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcolceQ61398 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcolceQ61398 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcolceQ61398 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcolceQ61398 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcolceQ61398 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PcolceQ61398 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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PcolceQ61398 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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PcolceQ61398 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PcolceQ61398 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PcolceQ61398 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcolceQ61398 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms