Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lamb3Q61087 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lamb3Q61087 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms