Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TmpoQ61033 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TmpoQ61033 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TmpoQ61033 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms