Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf3Q60980 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf3Q60980 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms