Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf4Q60793 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf4Q60793 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms