Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Utp20Q5XG71 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Utp20Q5XG71 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp20Q5XG71 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms