Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a3Q5XF89 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a3Q5XF89 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a3Q5XF89 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms