Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd5Q5VCS6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms