Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc5a6Q5U4D8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms