Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ssh2Q5SW75 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ssh2Q5SW75 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms