Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc42Q5SV66 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms