Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfasQ5SUR0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms