Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znrf3Q5SSZ7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znrf3Q5SSZ7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znrf3Q5SSZ7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms