Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf12Q5SPL2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf12Q5SPL2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf12Q5SPL2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms