Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I9

Trav2, T cell receptor alpha variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav2Q5R1I9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trav2Q5R1I9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav2Q5R1I9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms