Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SynaQ5G5D5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SynaQ5G5D5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SynaQ5G5D5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynaQ5G5D5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynaQ5G5D5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SynaQ5G5D5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SynaQ5G5D5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynaQ5G5D5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SynaQ5G5D5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms