Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3558Q5FWC9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3558Q5FWC9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3558Q5FWC9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3558Q5FWC9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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