Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc3Q5DU56 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrc3Q5DU56 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc3Q5DU56 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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