Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce1lQ5D525 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1lQ5D525 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms