Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Lrig2Q52KR2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrig2Q52KR2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms