Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srrm1Q52KI8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srrm1Q52KI8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srrm1Q52KI8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srrm1Q52KI8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srrm1Q52KI8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srrm1Q52KI8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms