Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccnl1Q52KE7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms