Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fam220aQ3ZN08 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms