Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1L6

Mtmr11, Myotubularin-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr11Q3V1L6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtmr11Q3V1L6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mtmr11Q3V1L6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtmr11Q3V1L6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtmr11Q3V1L6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtmr11Q3V1L6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtmr11Q3V1L6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtmr11Q3V1L6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtmr11Q3V1L6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtmr11Q3V1L6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtmr11Q3V1L6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtmr11Q3V1L6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtmr11Q3V1L6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms