Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms