Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc185Q3V118 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc185Q3V118 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms