Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms