Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

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Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dnah12Q3V0Q1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Dnah12Q3V0Q1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Dnah12Q3V0Q1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Dnah12Q3V0Q1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Dnah12Q3V0Q1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnah12Q3V0Q1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dnah12Q3V0Q1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dnah12Q3V0Q1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dnah12Q3V0Q1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dnah12Q3V0Q1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dnah12Q3V0Q1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms