Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rimbp3Q3V0F0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rimbp3Q3V0F0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms