Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
4933416C03RikQ3V063 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
4933416C03RikQ3V063 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933416C03RikQ3V063 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933416C03RikQ3V063 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933416C03RikQ3V063 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933416C03RikQ3V063 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933416C03RikQ3V063 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933416C03RikQ3V063 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933416C03RikQ3V063 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933416C03RikQ3V063 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933416C03RikQ3V063 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
4933416C03RikQ3V063 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933416C03RikQ3V063 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933416C03RikQ3V063 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933416C03RikQ3V063 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933416C03RikQ3V063 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933416C03RikQ3V063 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933416C03RikQ3V063 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933416C03RikQ3V063 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933416C03RikQ3V063 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933416C03RikQ3V063 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4933416C03RikQ3V063 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4933416C03RikQ3V063 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4933416C03RikQ3V063 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4933416C03RikQ3V063 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4933416C03RikQ3V063 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4933416C03RikQ3V063 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms