Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnaaf3Q3UYV8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnaaf3Q3UYV8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms