Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm5aQ3UXZ9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms