Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acsf3Q3URE1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acsf3Q3URE1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms