Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prrc1Q3UPH1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrc1Q3UPH1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms