Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp3Q3ULW8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Parp3Q3ULW8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms